虐杀原型存档游戏的方法非常简单，首先打开游戏，然后点击开始游戏，之后便可以使用快捷键（如F2）或在菜单中点击“存档”按钮，就可以将当前进度保存下来。在选择“存档”后，游戏将会自动把你在游戏中获得的经验和成就等信息保存下来。通常情况下，游戏会根据时间来自动分配存档的名称，此时你可以自行更改它们的名称和说明，还可以将它们存放到不同的文件夹当中，以便日后更方便的查找和使用。